Wierni poniosą krzyż między stacjami, w czasie nabożeństwa Drogi Krzyżowej odbywającego się w każdy piątek. Po jego zakończeniu oraz po Gorzkich Żalach w niedziele, będą mogli także ucałować krzyż, składając w ten sposób hołd dla głównego symbolu męki ukrzyżowanego Chrystusa, w którego postać tak jednoznacznie zapatrzony był Ojciec Święty.

25 marca 2005 r., Jan Paweł II nie mogąc, ze względu na ciężką chorobę, osobiście być w Koloseum, ze swojej kaplicy prywatnej, za pośrednictwem telewizji, łączył się duchowo w modlitwie z tymi, którzy odprawiali Drogę Krzyżową. Kardynał Camillo Ruini, który przewodniczył nabożeństwu, odczytał przesłanie Ojca Świętego i przez pierwsze dwie stacje niósł krzyż. Przy XIV stacji Jan Paweł II wziął krzyż w swoje ręce i objął go, co zostało ukazane całemu światu za pośrednictwem telewizji.

Krzyż, po śmierci Jana Pawła II, trafił do ks. kard. Stanisława Dziwisza, który na okres Wielkiego Postu przekazał go do Centrum „Nie lękajcie się!”.

Droga krzyżowa w Sanktuarium bł. Jana Pawła II sprawowana jest w każdy piątek Wielkiego Postu o godz. 18, Gorzkie Żale w niedziele o godz. 16. Sanktuarium zaprasza także na rekolekcje wielkopostne, które zaplanowane zostały w II, III i IV Niedzielę tego okresu, głoszone podczas Mszy św. o godz. 8, 10, 11:15 (dla dzieci), 12:30 i 17.