Liturgii Mszy św. w praskiej katedrze przewodniczył kardynał Dominik Duka, następca zmarłego Kardynała. Homilię wygłosił biskup František Radkovsky, biskup senior diecezji pilzneńskiej. Polski Episkopat reprezentował kardynał Stanisław Dziwisz.

W osobie kardynała Miloslava Vlka żegnano pasterza, który umiał poprowadzić wspólnotę Kościoła po trudnym okresie prześladowań komunistycznych. Był to czas odnowy struktur kościelnych, w tym łączenia wcześniejszych struktur oficjalnych i tzw. Kościoła podziemnego. Zmarły kardynał koordynował prace mające na celu nowe odczytanie dziedzictwa Jana Husa. Usilnie zabiegał o zwrot majątku kościelnego, w tym szczególnie katedry praskiej; był często odważnym krytykiem nowej rzeczywistości politycznej.

W pamięci wiernych pozostał jako pogodny pasterz, kochający ludzi, z radością spotykający się z każdą osobą.

Po Mszy św. ciało kardynała Miloslava Vlka zostało złożone w krypcie praskiej katedry, gdzie już spoczywają doczesne szczątki innych następców św. Wojciecha.